Cesta k Phantom Ganonovi
Před samotným soubojem na vás čeká ještě jedna malá hádanka. Místnost je rozdělená do několika pilířů, klecí a tlačítek. Tlačte středový pilíř proti směru hodinových ručiček a objeví se tlačítko. Tlačítko stiskněte. Opět tlačte středový pilíř ve stejném směru a objeví se další tlačítko. Postup opakujte a objeví se místnost s truhlou a zlatým pavoučkem.
Gold Skulltula (37/100):V závěrečné místnosti s otočným pilířem.
Ještě jednou zatlačte na sloupek proti směru hodinových ručiček, abyste získali přístup k poslednímu spínači. Jeho stisknutím otevřete bránu na opačné straně místnosti, která vede k závěrečnému souboji. Projděte velkými zamčenými dveřmi.
Phantom Ganon
Vyjděte po schodech nahoru a přejděte do středu místnosti. Zkuste se vrátit ke schodům; brána se před vámi zavře. Link se otočí a čeká ho velmi velké překvapení: Přízračný Ganon. Fantom Ganon odcválá do jednoho z obrazů. Postavte se do samého středu místnosti s nataženým lukem a šípem a stále otáčejte místností, abyste zjistili, ze kterého obrazu Ganon vyskočí. Ze dvou různých obrazů vyběhnou dva přízrační Ganonové; jeden je skutečný, druhý ne. Ten falešný se otočí (a není kolem něj fialová záře), zatímco pravý se začne vynořovat z obrazu. Vypusťte do skutečného šíp dříve, než stihne opustit obraz. Pokud ho nestihnete zasáhnout včas, rozběhněte se do stran, abyste se vyhnuli jeho útoku.
Po třetím zásahu Fantom Ganon tuto taktiku opustí a sesedne z koně. Fantom Ganon se pak bude vznášet po místnosti a vystřelí jeden projektil, do kterého musíte seknout, abyste ho odrazili zpět na něj. Chuť jeho vlastní medicíny ho srazí na zem, kde můžete pokračovat v bodání a sekání tolikrát, kolikrát jen dokážete, než se vrátí do vzduchu. Jak boj pokračuje, Fantom Ganon si uvědomuje vaši strategii a odráží vaše odražené střely v zuřivém ping-pongu, dokud jeden z vás neprohraje.
Saria vám dá lesní medailon. Přenesete se zpět na místo, kde stojí Velký strom Deku. Před ním vyrůstá veselý „Deku Tree Sprout“.
Gold Skulltula (38/100):Navštivte vesnici Kokiri v noci. Zlatý pavouk se nachází na domě dvojčat. Použijte „Hookshoot“.
Zpět ve svatyni času
Vraťte se zpět do svatyně času za „Sheik“ aby vás naučila píseň „Prelude of Light“. Tato píseň vám umožní se teleportovat zpět přímo do svatyně času. Ještě než se vydáte na vrcholek Mrtvé hory, můžete získat klisnu Eponu, a pak i čtvrtou láhev.